все таки я победил эту хрень.

собственно что было сделано
1. воткнул в сервер дополнительный сата контроллер, система загрузилась и поставила на него дрова.
2. переткнул системный винчестер на этот внешний контроллер, проверил что система грузится
3. переключил встроенный контроллер в режим рейда, найстроил зеркало.
4. загрузил систему, она нашла встроенный рейд контроллер, потужилась и поставила на него драйвера, увидела не размеченный виртуальный раздел.
5. склонировал акронисом системный диск висящий на внешнем контроллере на этот новый пустой раздел.
6. вынул старый системный диск вместе с доп контроллером из сервера и все, система грузится с рейда. [Ответ]

Сообщение от Zhelezniy_Felix:
5. склонировал акронисом системный диск висящий на внешнем контроллере на этот новый пустой раздел.

Только акронис не нужен. imho. (я сам не пробовал).

Можно было бы создать soft-raid средствами самой os. (синхронизировать системый диск с fake-raid) Как описывал, gena. [Ответ]